Clique para ver um exemplo.

<a href="#" onClick="window.open('http://www.SITE.com.br','Janela','toolbar=no,location=no,directories=no,status=no,menubar=no,scrollbars=yes,resizable=no,width=260,height=250'); return false;">liink</a>
Width=largura e height=altura.
O scrollbars=yes para a pop-up ter barra de rolagem e, scrollbars=no para a pop-up não ter barra de rolagem.